На примерe полной оптимизации геометрии кукурбит[6]урила в рамках теории функционала плотности проведено сравнение производительности программного пакета TeraChem, полностью основанного на технологии CUDA, с классическими квантово-химическими программными пакетами.
теория функционала плотности, квантовая химия, графический ускоритель, CUDA, TeraChem, density functional theory, quantum chemistry, GPU, CUDA, TeraChem
1. Маслий А.Н., Гришаева Т.Н., Кузнецов Ан.М., Баковец В.В. Журнал структурной химии. 2009. Т.49. № 3. С.413-418; Maslii A.N., Grishaeva T.N., Kuznetsov A.M., Bakovets V.V. Journal of Structural Chemistry. 2009. V.50. N.3. P.391-396.
2. Bakovets V.V., Masliy A.N., Kuznetsov A.M. J. Phys. Chem. B, 2008. V.112. № 38. P.12010-12013.
3. Kuznetsov A.M., Masliy A.N., German E.D., Korshin G.V. Journal of Electroanalytical Chemistry. 2004. V.573. № 2. P.315-325.
4. Кузнецов Ан.М., Маслий А.Н., Шапник М.С. Электрохимия. 2000. Т.36. №12. С.1477-1482; Kuznetsov A.M., Maslii A.N., Shapnik M.S. Russian Journal of Electrochemistry. 2000. V.36. №12. P.1309-1313.
5. Кузнецов Ан.М., Маслий А.Н., Кришталик Л.И. Электрохимия. 2008. Т.44. №1. С.39-47; Kuznetsov An.M., Maslii A.N., Krishtalik L.I. Russian Journal of Electrochemistry. 2008. V.44. №1. P.34-42.
6. Кузнецов Ан.М., Маслий А.Н., Кришталик Л.И. Электрохимия. 2009. Т.45. №1. С.87-92; Kuznetsov An.M., Maslii A.N., Krishtalik L.I. Russian Journal of Electrochemistry. 2009. V.45. №1. P.87-92.
7. Гришаева Т.Н., Маслий А.Н., Баковец В.В., Кузнецов А.М. Вестник Казанского технологического университета. 2011. №6. С.7-15.
8. Бутырская Е.В., Маслий А.Н., Кузнецов Ан.М., Шапошник В.А. Сорбционные и хроматографические процессы. 2001. Т.1. №1. С.25.
9. Параллельные вычисления CUDA [Офиц. сайт] URL: http://www.nvidia.ru/object/cuda-parallel-computing-ru.html.
10. OpenCL - The open standard for parallel programming of heterogeneous systems [Офиц. сайт] URL: http://www.khronos.org/opencl/
11. The Khronos Group Inc. [Офиц. сайт] URL: http://www.khronos.org/
12. Приложения для вычисления на GPU [Офиц. сайт] URL: http://www.nvidia.ru/object/gpu-computing-applications-ru.html
13. GPU applications [Офиц. сат] URL: http://www.nvidia.com/object/gpu-applications.html?cCtrY
14. Ufimtsev I.S. and Martinez T.J., J. Chem. Theory Comput., 2009, 5, p2619.
15. PetaChem [Офиц. сат] URL: http://www.petachem.com/
16. Gaussian 09, Revision B.01, M.J. Frisch, ..., J.B. Foresman, J.V. Ortiz, J. Cioslowski, D.J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2010.
17. Лайков Д.Н. Развитие экономного подхода к расчету молекул методом функционала плотности, его применение к решению сложных химических задач. Диссертация на соискание ст. к.ф.-м.н., МГУ, 2000.
18. Гришаева Т.Н., Маслий А.Н. Вестник Казанского технологического университета. 2012. Т.15. №12. С.7-11.
19. Kästner J., Carr J.M., Keal T.W., Thiel W., Wander A. and Sherwood P., J. Phys. Chem. A, 2009. V.113. P.11856-11862.
20. Becke, A.D., J. Chem. Phys. 1993. V.98. P.5648-5652.
21. R. Ditchfield, W. J. Hehre, and J. A. Pople, J. Chem. Phys., 1971. V.54. P.724-731.
22. Perdew J.P., Burke K., Ernzerhof M., Phys. Rev. Lett., 1996. V.77, P.3865-3868.